In eurer Kommandozentrale wird mit euren Kollegen Kriegsrat gehalten und die nächste Mission besprochen ehe ihr euch in den frei begehbaren Arealen auf Transformerjagd begeben dürft. Die Levels sind zu einem gewissen Grad zerstörbar und bieten euch die passende Plattform für bunte und explosionsreiche Schlachten. Allerdings gleichen sich die Abschnitte alle zu sehr und Levels wie eine Seeschlacht im Ozean bleiben die große Ausnahme.
Auch Bossfights gilt es in den Missionen ab und an zu bestreiten. Hier wurde versucht die großen Duelle der Filmvorlage, wie beispielsweise der Kampf zwischen Optimus und Demolisher in das Game zu integrieren, was einigermaßen gelungen ist, jedoch meistens in einer stumpfsinnigen Ballerei endet. Am Ende einer jeden Mission wird dann abgerechnet und ihr erhaltet Energon. Diese Energieeinheit müsst ihr zur Verbesserung verschiedenster Eigenschaften wie Lebensenergie, Boostzeit, Nahkampfschaden usw. einsetzen.
